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上海交大 , ,,,,,,同济大学NAR发文:肿瘤产生中染色质环调控新机造


乐投letou生物报路:近日 , ,,,,,,上海交通大学柴佩韦、文旭洋与同济大学丁天宜等合作 , ,,,,,,在国际驰名学术期刊《Nucleic Acids Research》(IF=11.502)上颁发钻研论文 , ,,,,,,对异常染色质环肿瘤产生中的职能及转录调控机理有了全新的意识 , ,,,,,,为肿瘤诊断和医治提供潜在的新靶点。。。。。。

脉络膜玄色素瘤(Uveal Melanoma , ,,,,,,UM))是成人最常见的眼内恶性肿瘤 , ,,,,,,恶性水平高 , ,,,,,,致盲率、致死率高。。。。。。约有50%的UM患者最终会产生转移 , ,,,,,,转移后均匀生计功夫仅半年。。。。。。UM发病是多基因病 , ,,,,,,由多种致病成分共同参加 , ,,,,,,如GNAQ/GNA11突变、MAPK信号通路激活、miRNA异常表白等。。。。。。经典遗传学以为 , ,,,,,,基因的表白和调控元件在染色体呈线性分列 , ,,,,,,然而细胞核中真实染色体状态往往以复杂的三维空间结构大局出现 , ,,,,,,染色体产生折叠或包装后 , ,,,,,,能从三维空间上对基因的表白进行调控。。。。。。然而 , ,,,,,,肿瘤特异性染色体三维构象在脉络膜玄色素瘤产生中的作用和机造尚不明显。。。。。。


柴佩韦、丁天宜蹬爪用转录组高通量测序技术(RNA-seq)结合高通量染色体构象分析(CTCF ChIP-seq、Hi-C)等技术伎俩 , ,,,,,,发现脉络膜玄色素瘤标本中神经降压素(NTS)显著高表白并伴有启动子区染色体构象异常。。。。。。首先 , ,,,,,,细胞尝试发现神经降压素推进脉络膜玄色素瘤细胞增殖、迁徙。。。。。。

在眼内原位荷瘤幼鼠模型也得到的了局 , ,,,,,,更沉要的是 , ,,,,,,在脉络膜玄色素瘤临床患者队列中发现 , ,,,,,,NTS在临床组织中高表白 , ,,,,,,并预示着患者的不良预后。。。。。。随后进一步钻研NTS异常转录的上游机造 , ,,,,,,利用染色体构象捕获(3C)技术 , ,,,,,,发现该启动子区域与上游800kb加强子形成癌染色质环 , ,,,,,,劫持该序列并形成癌加强子(Onco-enhancer) , ,,,,,,推进NTS基因表白。。。。。。

钻研发现 , ,,,,,,该染色质环为肿瘤特有 , ,,,,,,而正常组织细胞中无此构象。。。。。。利用CRISPR-Cas9基因编纂技术靶向删除特异结合的加强子区 , ,,,,,,染色体异常构象隐没 , ,,,,,,NTS基因被寡言 , ,,,,,,脉络膜玄色素瘤增殖和迁徙被显著抑造。。。。。。

该钻研率先揭示脉络膜玄色素瘤产生中染色体异常构象的关键作用和主题调控新机造 , ,,,,,,为脉络膜玄色素瘤早期诊断提供潜在靶点。。。。。。

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