乐投letou生物报路：近年来，，，，，，，生物学家已经在线性染色体周围发现了神秘的环状DNA。。。。。染色体表DNA（ecDNA）的扩增会推进肿瘤内的遗传异质性并加快肿瘤进化，，，，，，，不外，，，，，，，其频率和临床影响还不大明显。。。。。

美国杰克逊基因组医学尝试室和加州大学圣迭戈分校的钻研人员近日发展的一项钻研批注，，，，，，，患者肿瘤内若存在无着丝粒的染色体表环状DNA扩增，，，，，，，可能暗示癌症预后不良。。。。。这项成就于本周颁发在《Nature Genetics》杂志上。。。。。

钻研人员在文中写路：“乐投letou钻研了局展示了癌症中ecDNA的景观图。。。。？？？？？？？Ｋ伎嫉桨┲⒌囊熘市，，，，，，，分歧类型癌症之间的ecDNA结构和行为必然存在着多样性。。。。。”

钻研人员利用推算步骤来分析3,212名癌症患者的测序数据，，，，，，，以确定ecDNA扩增事务的频率。。。。。他们发现，，，，，，，这类扩增没有呈此刻正常组织样本中，，，，，，，但简直呈此刻各种类型的癌症中（血液癌症之表），，，，，，，并往往携带了癌基因。。。。。

他们发现，，，，，，，癌基因高度集中在扩增的ecDNA上，，，，，，，而最常见的癌基因频发扩增也呈此刻ecDNA上。。。。。他们指出，，，，，，，ecDNA扩增事务导致癌基因转录水平高于拷贝数匹配的线性DNA，，，，，，，再加上染色质可靠近性增长，，，，，，，导致转录本融合频仍产生。。。。。

值妥贴心的是，，，，，，，钻研人员发现，，，，，，，与统一癌症类型的非ecDNA肿瘤相比，，，，，，，肿瘤中ecDNA的存在通常对应了患者的预后较差，，，，，，，这批注ecDNA在肿瘤侵袭性中阐扬潜在作用，，，，，，，也批注有望利用ecDNA来预测患者预后。。。。。

钻研人员指出，，，，，，，从前很难通过细胞遗传学分析来统计ecDNA中产生的DNA扩增，，，，，，，但环状DNA文库富集步骤和全基因组精密分析步骤的出现让人们可能更全面地分析ecDNA及其在癌症中的后果。。。。。

在这项分析中，，，，，，，他们利用一种名为AmpliconArchitect的工具，，，，，，，凭据全基因组序列数据来沉建肿瘤内的部门扩增结构。。。。。之后，，，，，，，他们将其利用在3,200多个肿瘤样本和1,810个非肿瘤样本上，，，，，，，发现460个肿瘤至少携带一个环状扩增。。。。。

只管有些细节还不太明显，，，，，，，但作者以为，，，，，，，将来对结构变异及其他特点的钻研将有助于人们更好地相识形成蕴含ecDNA在内的基因组沉排的机造。。。。。

原文检索

Kim, H., Nguyen, N., Turner, K. et al. Extrachromosomal DNA is associated with oncogene amplification and poor outcome across multiple cancers. Nat Genet (2020). https://doi.org/10.1038/s41588-020-0678-2