丽江乐投letou生物报路:玛氏全球食品安全中心、美国佐治亚大学和康奈尔大学的钻研人员近日利用纳米孔测序技术开发出一种新步骤，，，，，可能在短短两幼时内确定沙门氏菌血清型，，，，，并在八幼时内实现整个鉴定过程。。。。。这项成就颁发在《Food Microbiology》杂志上，，，，，通讯作者是玛氏全球食品安全中心的Silin Tang博士。。。。。

沙门氏菌（Salmonella）是一种属于肠杆菌科的革兰氏阴性杆菌，，，，，也是腹泻病四大全球病因之一。。。。。腹泻固然是一种常见疾病！！！。，，，，但对于幼童而言，，，，，可能会带来严沉后果。。。。。大部门沙门氏菌病例的病情轻微，，，，，但有时也会危及性命。。。。。疾病的严沉水平取决于宿主成分和沙门氏菌血清型。。。。。

确定沙门氏菌的血清型，，，，，能够让食品安全的监管人员更容易找到细菌传染的源头。。。。。这种源头往往呈此刻各类食品中，，，，，蕴含水果、蔬菜、肉类、鸡蛋和奶制品等。。。。。不久前，，，，，法国就发作了沙门氏菌习染事务，，，，，据悉与食用生牛乳莫尔比耶奶酪有关。。。。。

从前，，，，，人们通常选取玻片凝聚尝试来判断沙门氏菌的血清型，，，，，但这必要拥有肯定经验的技术人员，，，，，也必要亏损大量的血清试剂。。。。。整个过程耗时较长，，，，，通常必要2-3天。。。。。随着测序技术的遍及，，，，，细菌的分子分型技术发展迅速，，，，，逐步取代传统分型步骤。。。。。如今，，，，，全球的食品安全监管机构和公共卫朝气构起头选取全基因组测序的步骤来进行病原体分型。。。。。

Illumina测序平台已成为食源性病原体分型的金尺度，，，，，但它也存在一些限度，，，，，蕴含周转功夫长，，，，，样品造备过程复杂，，，，，这限度了它在食品行业的使用。。。。。Oxford Nanopore Technologies测序平台是实时的长读长测序设备，，，，，可能天生微生物鉴定所用的数据。。。。。因而，，，，，钻研人员就索求了利用纳米孔测序平台是否能正确预测沙门氏菌的血清型。。。。。

他们利用GridION测序仪和R9.4测序芯片对38个沙门氏菌菌株（代表34种血清型）进行了最多2幼时的测序，，，，，并利用各类分歧的组装工具（蕴含Canu、Miniasm和Racon等）发展下游的生物信息学分析。。。。。他们同时利用Illumina HiSeq测序平台获取一样菌株的WGS数据，，，，，作为血清型预测的基准。。。。。

了局批注，，，，，利用纳米孔测序30分钟、45分钟、1幼时和2幼时天生的WGS数据进行预测的了局均与基于Illumina WGS数据的预测了局相符。。。。。这项钻研证实了纳米孔测序平台与Illumina测序平台在血清型预测上的正确性相当。。。。。

康奈尔大学的食品安全学教授Martin Wiedmann暗示，，，，，这对于食品行衣反说是一个沉要新闻，，，，，由于很少有尝试室能够进行经典的血清分型，，，，，通常必要送到经过认证的尝试室。。。。。如今，，，，，依附单一的设备即可发展全基因组测序。。。。。“此刻，，，，，你能够在食品加工厂左近的尝试室中进行检测，，，，，”他说。。。。。