丽江乐投letou生物报路：香港中文大学卢煜明（Dennis Lo）教授辅导的钻研团队近日从孕妇血浆中鉴定出母亲和胎儿的环状游离DNA，，，，，，，，这为无创产前检测提供了一种新型的生物标志物。。。。。这项成就于1月3日颁发在〖国科学院院刊》（PNAS）上。。。。。

早在十年前，，，，，，，，卢煜明教授就发现，，，，，，，，利用母体的血浆样本可能获得胎儿的全基因组图谱，，，，，，，，这项沉要的成就成为无创产前检测（NIPT）的里程碑。。。。。不外，，，，，，，，之前的钻研重要是基于线性DNA片段。。。。。只管在幼鼠血浆中曾观察到染色体表环状DNA（eccDNA），，，，，，，，但尚未在孕妇血浆中检测到这种分子。。。。。

卢煜明及其同事这次从孕妇血浆中分离出eccDNA分子并发展测序。。。。。他们发现，，，，，，，，胎儿起源的eccDNA分子通常比母体起源的分子更短。。。。。鉴于eccDNA对核酸表切酶的耐受性更好，，，，，，，，故比线性DNA更不变。。。。。“母体血浆中的eccDNA为迅速发展的无创产前检测领域增添了新工具，，，，，，，，”作者在文中写路。。。。。

图 eccDNA的鉴定流程（图片来自原文）

在这项钻研中，，，，，，，，钻研人员分析了五名孕妇的血浆DNA。。。。。在富集了环状DNA之后，，，，，，，，他们利用限度性内切酶MspI将其线性化，，，，，，，，接着利用Illumina的HiSeq 1500/2500平台对eccDNA分子进行测序。。。。。

利用母体和胎儿特异性SNP，，，，，，，，钻研人员确定了eccDNA分子的起源。。。。。他们发现，，，，，，，，胎儿起源的eccDNA分子通常比母体起源的eccDNA分子更短，，，，，，，，均匀长度约为202 bp，，，，，，，，而母体eccDNA的均匀分子量约为338 bp。。。。。他们指出，，，，，，，，这与线性游离DNA的了局一致。。。。。

不外，，，，，，，，他们疑惑限度性内切酶MspI的消化影响了能够分析的eccDNA部门。。。。。为了证实他们的了局，，，，，，，，他们还使用了一种标签片段化（tagmentation）的步骤，，，，，，，，从另一组五名孕妇中分离并分析eccDNA。。。。。

与限度性内切酶步骤相比，，，，，，，，这种步骤鉴定出的eccDNA分子要多得多，，，，，，，，而胎儿eccDNA同样幼于母体eccDNA。。。。。之后钻研人员将eccDNA定位回基因组，，，，，，，，发现他们集中在5’-非翻译区、表显子区和CpG岛区域，，，，，，，，批注环状DNA并不是从基因组中随机产生的。。。。。

eccDNA中也存在反复出现的模式：肇始位点和终止位点的两侧均伴有三核苷酸motif序列，，，，，，，，中央存在4 bp的距离区。。。。。他们在进一步分析这些模式后批注，，，，，，，，双链DNA形成eccDNA的机造是同源沉组和微同源介导的结尾衔接。。。。。

不外，，，，，，，，钻研人员也指出，，，，，，，，基于限度性内切酶和标签片段化的步骤城市选择性地作用于双链DNA，，，，，，，，这可能导致他们低估单链eccDNA的存在。。。。。

卢煜明及其同事以为，，，，，，，，由于环状DNA比线性DNA更为不变，，，，，，，，来自母体血浆的eccDNA最终有望成为生物标志物。。。。。在将来的钻研中，，，，，，，，他们有意索求各类怀胎有关疾病的eccDNA图谱的异常，，，，，，，，好比预兆子痫和早产。。。。。

原文检索

Identification and characterization of extrachromosomal circular DNA in maternal plasma

Proceedings of the National Academy of Sciences Jan 2020, 201914949; DOI: 10.1073/pnas.1914949117