丽江乐投letou生物报路：单细胞测序技术是一种在单细胞水平上对基因组、转录组、表观组等进行高通量测序分析的技术。。。。。单细胞测序技术可能在组学水平揭示细胞间的异质性。。。。。单细胞水平细胞谱系追踪技术位居2018年《Science》杂志评比的十大科学突破之首。。。。。通例单细胞转录组测序技术迷失了细胞在原组织中至关沉要的空间位相信息，，，，，，，而单细胞空间转录组技术在进行单细胞转录组测序的同时保留并纪录了细胞的空间位相信息。。。。？？？？？？占渥甲榧际蹩赡芙沂鞠赴涞南嗷プ饔靡约跋赴Φ奈⒒肪常，，，，，将成为发育生物学、神经生物学、免疫生物学、肿瘤微环境等领域的钻研利器。。。。。

2019年11月12日，，，，，，，Nucleic Acids Research在线颁发了中科院生物物理所高通量测序中心标题为“SpatialDB: a database for spatially resolved transcriptomes”的论文，，，，，，，颁布第一个单细胞空间转录组数据库及数据在线可视化平台。。。。。SpatialDB系统收录了来自5个物种由8种空间转录组技术产生的数据，，，，，，，成立了空间转录组数据分析处置流程，，，，，，，实现了空间转录组数据的在线可视化，，，，，，，同时提供了空间差距表白基因及其职能富集分析的注解。。。。。

SpatialDB的开发工作重要由中国科学院生物物理钻研所高通量测序中心(http://159.226.118.31/CHTS/)实现。。。。。该中心于2014年在陈润生院士辅导下成立，，，，，，，至今已累计为所内表数十个课题组和单元提供了超过1.5万机时的高通量测序服务。。。。。除了提供通例测序服务之表，，，，，，，中心适应测序技术发展方向，，，，，，，不休开发新技术新步骤，，，，，，，致力建成创新型测序中心。。。。。中心成立并优化了低肇始量文库造备、单链DNA文库造备等尝试技术，，，，，，，开发了高通量测序数据分析和可视化新步骤，，，，，，，申请发现专利2项，，，，，，，并已授权。。。。。

为满足钻研所单细胞测序需要，，，，，，，中心近期引进了10x Genomics单细胞文库造备系统，，，，，，，可能提供21种单细胞测序服务。。。。。2019年9月10x Genomics公司推出了空间转录组测序服务，，，，，，，中心与10x Genomics中国代理公司成立合作，，，，，，，共同提供空间转录组技术服务。。。。。高通量测序仪价值昂贵且更新换代速度快，，，，，，，持久被国表公司垄断，，，，，，，为解决高通量测序仪“卡脖子”问题，，，，，，，中心于2019岁首引进了国产高通量测序仪，，，，，，，在保障测序质量和产出量的同时，，，，，，，测序成本也降到了国表测序仪的水平。。。。。为了更好的提供高通量测序服务，，，，，，，中心进行了通例技术讲座，，，，，，，对有特殊需要的用户提供专门的技术支持。。。。。关于高通量测序中心的更多信息，，，，，，，请接见中心网站：http://159.226.118.31/CHTS/

中国科学院生物物理钻研所陈润生院士、陈幼伟高级工程师为本文共同通讯作者。。。。。中国科学院生物物理钻研所高通量测序中心范珍高级工程师为本文第一作者。。。。。感激科学钻研平台韩玉刚主任和李雪梅副主任持久以来的援手和支持。。。。。该文章获得中国科学院关键技术人才项目、国度天然科学基金[31871307, 31801072, 31701122, 31520103905]和国度沉点研发项目[2018YFA0106901]的赞助。。。。。

原文标题：

SpatialDB: a database for spatially resolved transcriptomes