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福建农林大学颁发Nature Genetics封面文章:高质量菠萝基因组


丽江乐投letou生物报路:菠萝是沉要的热带水果和参观植物,,,,,,,发源于南美洲,,,,,,,目前全球有88个国度和地域种植,,,,,,,海峡两岸地域是我国菠萝的主产区,,,,,,,我国菠萝年产值约占全球总产值的六分之一。。。 。 。。。菠萝由于受自交不亲和的影响,,,,,,,重要通过无性滋生。。。 。 。。。对于无性滋生的驯化,,,,,,,有假说以为是“一步到位”过程,,,,,,,即被驯化的作物与它的野生祖先之间只相隔一代,,,,,,,或少数几代,,,,,,,一旦一个种类被选定,,,,,,,选择的过程也就实现了。。。 。 。。。有性生殖对于菠萝的驯化过程是否有影响,,,,,,,也不明显。。。 。 。。。

福建农林大学海峡结合钻研院基因组与生物技术钻研中心明瑞光教授团队颁发了题为“The bracteatus pineapple genome and domestication of clonally propagated crops”的文章,,,,,,,在高质量菠萝基因组与菠萝驯化机造钻研方面获得突破性进展。。。 。 。。。

这一钻研发现颁布在Nature Genetics杂志封面上,,,,,,,文章通讯作者为明瑞光教授,,,,,,,第一作者为陈立余副教授。。。 。 。。。

该钻研在解析无性滋生作物驯化机造方面获得了突破性进展。。。 。 。。。钻研人员通过对89种栽培菠萝和野生种进行沉测序,,,,,,,并发展群体遗传学基因结构分析、有丝割裂选择信号分析、减数割裂选择断根区域分析和同义、非同义位点频率普分析,,,,,,,证明菠萝驯化过程是有性生殖和“一步到位”共同起作用的。。。 。 。。。这是初次用大规模;;;;蜃樾蛄惺堇囱橹ぁ耙徊降轿弧奔偎。。。 。 。。。该发此刻概想上是全新的,,,,,,,并为若何钻研有性和无性生殖过程对于无性滋生作物家驯化的作用提供范例,,,,,,,为利用基因组选择急剧驯化无性滋生作物提供了理论凭据。。。 。 。。。

此表,,,,,,,在该项钻研中,,,,,,,钻研人员还通过PacBio长片段测序和Hi-C辅助物理作图的步骤,,,,,,,将参观菠萝bracteatus CB5的基因组组装到染色体水平。。。 。 。。。这一高质量的基因组校对了已颁发的水果菠萝F153基因组组装中的两处谬误。。。 。 。。。

该项钻研通过比力基因组学的伎俩,,,,,,,解析了菠萝中纤维素合成、花青素堆集、高蛋白水解酶含量,,,,,,,糖分转运和自交不亲和机造产生的遗传学基础。。。 。 。。。


原文标题:

The bracteatus pineapple genome and domestication of clonally propagated crops

https://www.nature.com/articles/s41588-019-0506-8

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