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魏文胜Nature Biotechnology报路新型RNA单碱基编纂技术:LEAPER


丽江乐投letou生物报路:近年来,,,,,以CRISPR/Cas9为代表的基因组编纂技术在生物医学等诸多领域产生了深远的影响,,,,,但该技术目前存在的一系列问题使其在临床医治利用中遭逢瓶颈。。。。。。问题的本原之一在于当前的基因编纂系统依赖于表源编纂酶或效应蛋白的表白,,,,,从而造成 (1) 蛋白分子量过大使得通过病毒载体进行装载及人体内递送极度难题 ;;;;;; ;(2) 由蛋白过表白引起的DNA/RNA水平的脱靶效应 ;;;;;; ;(3) 由表源蛋白表白引起的机体免疫反映及危险 ;;;;;; ;(4) 机体内的预存抗体使表源编纂酶或效应蛋白被中和从而导致基因编纂失败等。。。。。。

为解决上述问题,,,,,亟需成立新型基因编纂工具,,,,,出格是脱节传统技术依赖于表源蛋白表白的镣铐。。。。。。来自北京大学性命科学学院魏文胜课题组颁发了题为“Programmable RNA editing by recruiting endogenous ADAR using engineered RNAs”的文章,,,,,初次报路了名为LEAPER的新型RNA 单碱基编纂技术。。。。。。与传统的核酸编纂技术必要向细胞同时递送编纂酶(如Cas蛋白)及向导RNA分歧,,,,,LEAPER系统仅必要在细胞中表白向导RNA即可招募细胞内源脱氨酶实现靶向指标RNA的编纂。。。。。。

这一钻研发现颁布在7月15日的Nature Biotechnology杂志上。。。。。。利用该技术,,,,,钻研人员在一系列疾病有关基因转录本中实现了高效、精准的编纂,,,,,并成功建复了起源于Hurler综合征病人的α-L-艾杜糖醛酸酶缺点细胞。。。。。。该技术的成立为性命科学基础钻研和疾病医治提供了一种全新的工具。。。。。。

ADAR (Adenosine deaminase acting on RNA) 是一类在人体内各组织中宽泛表白的腺苷脱氨酶,,,,,可能催化RNA分子中腺苷A→肌苷I(鸟苷G)的转换。。。。。。相比DNA编纂,,,,,RNA编纂不必要对基因组序列进行永远性扭转,,,,,这种可逆的、易于调控的编纂方式在安全性上可能更具优势。。。。。。

麻省理工学院张锋课题组曾报路,,,,,过表白Cas13-ADAR融合蛋白及向导RNA能够实现靶向指标RNA的精准编纂 (Science 2017),,,,,但是该步骤无法解决表源蛋白表白造成的问题。。。。。。魏文胜课题组在钻研中初次发现,,,,,只需转入一条特殊设计的RNA (arRNA, ADAR-recruiting RNA),,,,,就可能通过招募细胞内源的ADAR1 蛋白对靶向基因转录本上特定的腺苷产生高效精准的编纂,,,,,并不必要引入任何表源效应蛋白。。。。。。ADAR1基因敲除与回补尝试和高通量测序分析批注,,,,,细胞内源的ADAR1 蛋白介导了这一过程。。。。。。这种新型RNA编纂技术被定名为LEAPER (Leveraging Endogenous ADAR for Programmable Editing on RNA)。。。。。。

深刻钻研批注LEAPER拥有宽泛的合用性,,,,,能对RNA分子上绝大无数的腺苷酸位点进行精准编纂。。。。。。在人的原代细胞-蕴含肺成纤维细胞、支气管上皮细胞及T细胞中,,,,,LEAPER的编纂效能最高可达80%,,,,,显示出该技术在疾病医治中巨大的利用远景。。。。。。在诸多利用尝试中,,,,,LEAPER的高效、精准的个性得到充分验证。。。。。。好比LEAPER能够通过建复抑癌基因TP53中的致病突变来复原p53突变体的转录调节职能。。。。。。此表,,,,,在Hurler综合征患者起源的原代细胞中,,,,,LEAPER可能成功建复致病突变,,,,,并复原细胞中的α-L-艾杜糖醛酸酶的催化活性。。。。。。

近期的钻研批注,,,,,DNA单碱基编纂技术,,,,,蕴含胞嘧啶碱基编纂器和腺嘌呤碱基编纂器在RNA或DNA水平上产生了严沉的脱靶景象 (Science 2019; Nature 2019),,,,,引发人们对其安全性的忧郁。。。。。。利用RNA-Seq技术在转录组水平对LEAPER技术进行的评估,,,,,没有观测到显著的脱靶景象,,,,,显示了新技术的高度特异性。。。。。。另表,,,,,LEAPER不影响内源ADAR蛋白的正常职能,,,,,也不会激活细胞中的天然免疫反映,,,,,批注其是一类安全的基因编纂工具。。。。。。

与RNAi类似,,,,,LEAPER充分利用了细胞中天然存在的机造:仅用一条RNA 就实现了精确高效的RNA单碱基编纂,,,,,从而预防了任何由于表白表源效应蛋白而引起的各类潜在问题。。。。。。这种新型的基因编纂技术在科学钻研和疾病医治中显示出可观的优势与潜能,,,,,同时也为发展基于细胞内源机造的基因编纂技术指了然方向。。。。。。

近期,,,,,Thorsten Stafforst课题组报路了定名为RESTORE (recruiting endogenous ADAR to specific transcripts for oligonucleotide-mediated RNA editing) 的RNA编纂步骤 (Nature Biotechnology 2019)。。。。。。与LEAPER类似,,,,,RESTORE也可能利用内源ADAR进行靶向RNA的精准编纂 ;;;;;; ;分歧之处在于,,,,,RESTORE中的向导RNA是一段化学合成的寡核苷酸,,,,,为维吃熹不变性,,,,,必要进行大量化学建饰。。。。。。而LEAPER能够通过不变表白的方式在细胞内阐扬作用,,,,,因而合用于装载至腺有关病毒 (AAV)、慢病毒等载体中,,,,,在递送至机体后持续阐扬职能。。。。。。

原文标题:

Programmable RNA editing by recruiting endogenous ADAR using engineered RNAs

https://www.nature.com/articles/s41587-019-0178-z

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