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Nature Communications:第二代的锌指核酸酶技术


丽江乐投letou生物报路:Sangamo Therapeutics公司的钻研人员上周五在《Nature Communications》杂志上颁发题为“Diversifying the Structure of Zinc Finger Nucleases for High-Precision Genome Editing”的文章,,, ,,,展示了其第二代的锌指核酸酶(ZFN)技术。。。。。。。。

据Sangamo介绍,,, ,,,这些改进使得ZFN的多样性增长到64倍,,, ,,,从而有望对特定基因组位点进行高度精确的编纂。。。。。。。。文章的通讯作者Edward J. Rebar博士是Sangamo的高级副总裁兼首席技术官,,, ,,,第一作者是David Paschon博士。。。。。。。。

Paschon博士及其同事通过一系列蛋白质刷新工作,,, ,,,开发出新的ZFN结构。。。。。。。。这些刷新蕴含颠倒DNA结合结构域和核酸酶结构域的挨次,,, ,,,以及使用新的接头(linker)跳过相邻锌指之间的碱基。。。。。。。。通过这种结构多样化的战术,,, ,,,他们试图大幅度提高ZFN的靶向精确度。。。。。。。。


(图片来自原文,,, ,,,红色部门为接头)

钻研人员开发出一系列新接头,,, ,,,可能跳过锌指-锌指以及锌指-FokI切割结构域之间的碱基。。。。。。。。他们报路称,,, ,,,这些刷新使得ZFN结构的数量增长到64倍,,, ,,,可能实现肆意位点的靶向切割。。。。。。。。他们还评估了30种新结构,,, ,,,确定其中97%为活性核酸酶。。。。。。。。

“乐投letou钻研批注,,, ,,,乐投letou接头元件可能与现有的锌指结合,,, ,,,以靠近1.0的密度靶向肆意基因组片段,,, ,,,也就是说,,, ,,,ZFN可能靶向险些每一个碱基。。。。。。。。同时我们还批注,,, ,,,这些结构改进有望显著提高ZFN的靶向精确度,,, ,,,”钻研人员写路。。。。。。。。

让ZFN更有吸引力

同为基因编纂技术,,, ,,,人们未免将ZFN与CRISPR进行比力。。。。。。。。一向以来,,, ,,,人们对ZFN的品评蕴含与CRISPR相比成本太高、速度太慢,,, ,,,以及开发高质量基因编纂产品的门槛过高。。。。。。。。为此,,, ,,,Sangamo一向致力于缩短ZFN的开发周期。。。。。。。。

“这种新结构显著提高了乐投letou靶向能力,,, ,,,将确保我们可能靶向最佳序列窗口,,, ,,,实现医治利用。。。。。。。。这说了然我们ZFN基因组编纂技术的多职能性,,, ,,,”Rebar博士谈路。。。。。。。。

“在开发医治用的核酸酶时,,, ,,,关键要求是可能定位临床成效最佳的双链断裂。。。。。。。。在很多情况下,,, ,,,这一思考使得最佳切割指标只能限度在狭幼的窗口。。。。。。。。因而,,, ,,,提高靶向精确度一向是人们持久关注的问题,,, ,,,”Rebar补充路。。。。。。。。

此前一个月,,, ,,,Sangamo颁发了利用ZFN技术医治粘多糖贮积症(MPS)的I/II期临床试验的中期了局。。。。。。。。只管钻研证实了疗法的安全性以及关键酶的表白,,, ,,,但没有获得公司进展的成效。。。。。。。。

“它简直在阐扬作用,,, ,,,但不及以带来临床受益,,, ,,,”Sangamo的CEO Sandy Macrae说。。。。。。。。这些中期了局导致Sangamo的股价大幅着落,,, ,,,从12.02美元跌至8.31美元,,, ,,,之后才逐步反弹。。。。。。。。

为人们带来更多选择

在这项钻研中,,, ,,,Sangamo的钻研人员暗示,,, ,,,他们开发出新的接头,,, ,,,可能将FokI核酸酶结构域与DNA结合锌指结构域的N端衔接,,, ,,,而以往只能与锌指结构域的C端衔接。。。。。。。。据介绍,,, ,,,这种设计产生了三种代替的ZFN二聚体,,, ,,,让设计ZFN时的选择增长到四倍。。。。。。。。

同时,,, ,,,新的接头也允许相邻锌指之间的碱基跳跃。。。。。。。。这样,,, ,,,经过刷新的锌指就可能与部门移位的DNA序列相结合,,, ,,,同时保留一样的切割位点。。。。。。。。如此一来,,, ,,,人们的设计选择又增长到16倍。。。。。。。。

“将这两项改进纳入乐投letouZFN平台,,, ,,,使得在职何指标位点进行有效基因组编纂的ZFN设计选项增长到64倍,,, ,,,”钻研人员汇报称。。。。。。。。他们暗示,,, ,,,这些新型结构在三种医治利用中阐发出杰出的效能、精确度和特异性。。。。。。。。

将来,,, ,,,这种接头也有望利用在TALENs、FokI-dCas9和Cas9等碱基编纂器中,,, ,,,以改善这些系统的机能。。。。。。。。

原文检索

Diversifying the structure of zinc finger nucleases for high-precision genome editing

Nature Communications 10, Article number: 1133 (2019)

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