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Nature子刊:新技术揭示神经细胞的主题转录特点


丽江乐投letou生物报路:成年人的中枢神经系统由1700亿个细胞组成,,,,, ,,,其中一半是神经元,,,,, ,,,其余的则蕴含少突胶质细胞、星形胶质细胞和幼胶质细胞 。。。。。。。一向以来,,,,, ,,,人们都尝试相识这些细胞之间的异质性 。。。。。。。到底是哪些基因的表白让这些细胞彼此分歧???????

因而,,,,, ,,,人们分离这些细胞,,,,, ,,,并测定分子图谱 。。。。。。。通过测序每个细胞中的RNA,,,,, ,,,钻研人员可能确定特定组织有哪些基因“开启” 。。。。。。。不外,,,,, ,,,这种单细胞分离技术很难利用在人类大脑中娇嫩的神经元上,,,,, ,,,同时也拥有统计学上的局限性 。。。。。。。

为此,,,,, ,,,美国加州大学旧金山分校的钻研人员对齐全的组织样本进行分析 。。。。。。。他们发现,,,,, ,,,通过采集脑组织样本,,,,, ,,,大量提取RNA并寻找基因表白的特点模式,,,,, ,,,能够确定细胞身份 。。。。。。。这项钻研成就颁发在《Nature Neuroscience》杂志上 。。。。。。。


钻研路线(图片来自原文)

在这项钻研中,,,,, ,,,钻研人员汇集从前多项钻研的数据,,,,, ,,,对840名成年人捐献的7,221个组织样本进行分析 。。。。。。。他们如果,,,,, ,,,若是每种类型的细胞都有着基因表白的特点模式,,,,, ,,,那么这些特点将在多个组织样本中一致地出现 。。。。。。;;;;;;;;痪浠八担,,,, ,,,细胞的特定搭配使得整体的基因表白能够预测 。。。。。。。

钻研人员利用已颁发的数据集和细胞身份标志物,,,,, ,,,揭示了中枢神经系统中各类细胞的主题转录特点,,,,, ,,,蕴含神经元、少突胶质细胞、星形胶质细胞和幼胶质细胞等 。。。。。。。与FACS和单细胞分选等步骤相比,,,,, ,,,这种步骤能预防组织解离或cDNA预扩增引起的技术差距,,,,, ,,,也能预防捕获细胞或细胞核时的采样偏倚 。。。。。。。

凭据细胞组成的变动,,,,, ,,,钻研人员对齐全组织样本的转录组进行建模 。。。。。。。他们能确定疾病、大脑区域和物种之间的转录差距 。。。。。。。这项新技术有望援手钻研人员预测哪些细胞或哪个区域是特定疾病的重要指标 。。。。。。。

他们已经利用该技术对增长阿尔茨海默病风险的基因进行建模 。。。。。。。他们发现,,,,, ,,,与早发性阿尔茨海默病有关的两个基因APP和PSEN1别离由神经元和少突胶质细胞表白 。。。。。。。相比之下,,,,, ,,,与晚发性阿尔茨海默病有关的两个基因APOE和TREM2,,,,, ,,,重要由星形胶质细胞和幼胶质细胞表白 。。。。。。。这些发现暗示了特定细胞类型的转录变动引起了疾病的分歧阐发 。。。。。。。

钻研人员还鉴定了重要细胞在大脑区域中的转录差距 。。。。。。。利用多个数据集,,,,, ,,,他们推算了每个区域的表白保真度 。。。。。。。对于神经元而言,,,,, ,,,表白保真度的区域差距最大 。。。。。。。相反,,,,, ,,,少突胶质细胞在各个区域的表白保真度极为类似 。。。。。。。幼胶质细胞和星形胶质细胞则居于两者之间 。。。。。。。

此表,,,,, ,,,他们还鉴定了各个物种之间的重要细胞转录差距 。。。。。。。他们分析了1,346个幼鼠脑转录组,,,,, ,,,以确定各类细胞的基因组表白保真度 。。。。。。。对于每种细胞,,,,, ,,,他们发现人和幼鼠的表白保真度显著有关,,,,, ,,,其中神经元有着最大的类似性 。。。。。。。这些了局批注与胶质细胞相比,,,,, ,,,神经元在进化上受到更大的约束 。。。。。。。在AAV构建过程中,,,,, ,,,他们选择了赛业生物(Cyagen Biosciences)的服务 。。。。。。。

目前,,,,, ,,,钻研人员已经在网站(http://oldhamlab.ctec.ucsf.edu/)上颁布了钻研数据 。。。。。。。这些资源将援手科学家轻松确定大脑中的分歧细胞表白哪些基因,,,,, ,,,以及这些细胞通常在哪个地位 。。。。。。。

原文检索

Variation among intact tissue samples reveals the core transcriptional features of human CNS cell classes

Nature Neuroscience 21, 1171–1184 (2018)

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