丽江乐投letou生物报路：结直肠癌是胃肠路中常见的恶性肿瘤。。。。。；；；；；蜃椴徊槐湫浴⒈砉垡糯斐Ｒ约盎虮戆资У魇墙嶂背Π┑牡湫头肿犹氐。。。。。以往的单细胞钻研只能别离检测基因组、甲基化组或转录组，，，，，而不能以单细胞分辨率同时发展多组学钻研。。。。。

为了更好地相识结直肠癌的发展，，，，，北京大学的钻研团队开发出一种单细胞测序步骤，，，，，不仅可能分析单细胞的基因表白，，，，，还可能分析拷贝数变异和表观遗传异常。。。。。这有助于相识肿瘤内部的异质性，，，，，以及肿瘤转移的机造，，，，，为转移性结直肠癌的医治提供了新的理论凭据。。。。。

这项题为“Single-cell multiomics sequencing and analyses of human colorectal cancer”的文章于11月30日颁发在《Science》杂志上。。。。。北京大学生物医学前沿创新中心的汤富酬教授、北京大学第三医院的乔杰教授、付卫教授为共同通讯作者。。。。。

2016年，，，，，汤富酬教授及其合作者曾在《Cell Research》上颁发论文，，，，，介绍一种单细胞三沉组学测序技术scTrio-seq。。。。。这是首个对单细胞的基因表白、拷贝数扭转以及DNA甲基化进行同时辰析的技术。。。。。

在这次新钻研中，，，，，钻研人员选取了一种称为scTrio-seq2的新步骤。。。。。这种步骤将单细胞亚硫酸氢盐测序与全基因组甲基化分析相结合，，，，，并提高了检测效能。。。。。此表，，，，，他们大大提高了分析的细胞数量，，，，，从之前的25个提高到此刻的1,900个。。。。。

钻研人员将这种步骤利用在12名结直肠癌患者身上，，，，，其中10名患者有原发性肿瘤和转移性肿瘤的匹配数据，，，，，这使得他们可能鉴定出每位患者的克隆突变形成的遗传谱系，，，，，并将基因表白、拷贝数和甲基化数据有关联。。。。。

他们对10名患者的原发位和转移位肿瘤进行多点采样，，，，，这让他们可能追踪肿瘤转移的过程。。。。。此表，，，，，肿瘤内多个部位的采样让他们可能鉴定瘤内异质性。。。。。

钻研人员利用拷贝数信息和甲基化数据来鉴定患者原发性肿瘤内的遗传谱系，，，，，并追踪肿瘤转移过程中的进化。。。。。例如，，，，，他们从一名患者的原发性肿瘤中鉴定出12个亚谱系。。。。。单细胞数据批注，，，，，原发性肿瘤往往比转移性肿瘤更复杂。。。。。

再来看甲基化数据。。。。。钻研人员发现只管统一遗传亚谱系内的细胞甲基化是一致的，，，，，但各个谱系的甲基化水平分歧，，，，，并且与邻近的正常细胞也分歧。。。。。在癌细胞中，，，，，他们发现DNA低甲基化重要集中在长结尾沉复序列，，，，，长散在沉复序列和异染色质区域，，，，，而DNA高甲基化集中在CpG岛和盛开染色质。。。。。

当钻研人员观察甲基化状态与染色体扭转之间的关系时，，，，，他们发现有六条染色体往往显示出比其他染色体更高的去甲基化水平，，，，，并且8号、13号、和18号染色体也拥有高频的拷贝数变异。。。。。

“这种单细胞多组学测序为相识结直肠癌发展和转移过程中的分子扭转提供了见解和资源，，，，，”作者在文中写路。。。。。

原文检索

Single-cell multiomics sequencing and analyses of human colorectal cancer

Science  30 Nov 2018:
Vol. 362, Issue 6418, pp. 1060-1063
DOI: 10.1126/science.aao3791