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Nature子刊:改进几十年前的新步骤 破译DNA表观遗传密码


丽江乐投letou生物报路:宾州大学Perelman医学院的钻研人员研发出了一种新步骤,,,,,, ,能够对附着在DNA表表的化学基团进行测序,,,,,, ,从而为更好地检测血液中的癌症和其他疾病摊平路路。。。。。。。这些化学基团能象征基因组中四个DNA“字母”中的一个,,,,,, ,在表白或寡言的基因中存在差距。。。。。。。

这一钻研成就颁布在Nature Biotechnology杂志上。。。。。。。

为了更早地检测疾病并提高精确度,,,,,, ,此刻科学家们越来越关注表周血的钻研了,,,,,, ,也就是在有限的环境中分析自由漂浮的DNA,,,,,, ,例如从肿瘤进入血液中的DNA。。。。。。。

“我们但愿这种步骤可能解码以前难以钻研的幼细胞和瞬时细胞群DNA上的表观遗传象征,,,,,, ,确定DNA是来自特定组织还是来自肿瘤,,,,,, ,”文章的资深作者Rahul Kohli博士说。。。。。。。

宾州大学等处的钻研人员在从前二十年中一向钻研了这些DNA建饰,,,,,, ,但愿能更好地相识和诊断一系列疾病,,,,,, ,出格是癌症。。。。。。。在从前的几十年中,,,,,, ,用于破译表观遗传密码的重要步骤依赖于一种叫做亚硫酸氢盐的化学物质。。。。。。。固然亚硫酸氢盐已被证明是有效的,,,,,, ,但它也存在重要局限性:它无法分辨DNA基础碱基上最常见的建饰,,,,,, ,更沉要的是,,,,,, ,它会粉碎所接触的大部门DNA,,,,,, ,因而无法在尝试室中进行后续钻研。。。。。。。

这项钻研描述的新步骤成立一类称为APOBEC DNA脱氨酶的免疫防御酶上,,,,,, ,这些脱氨酶疏导的化学反映可能实现亚硫酸氢盐的作用,,,,,, ,但不会侵害DNA。。。。。。。

“这项技术进取为更好地理解复杂的生物过程摊平了路路,,,,,, ,例如神经系统若何发展或肿瘤若何发展的,,,,,, ,”文章另表一位作者Hao Wu博士说。。。。。。。

钻研人员利用这种步骤,,,,,, ,确定了一种神经元的表观遗传密码,,,,,, ,并且他们使用的DNA量比依赖亚硫酸氢盐的步骤所需的DNA少1000倍。。。。。。。此表,,,,,, ,新步骤还能够分辨两种最常见的表观遗传象征,,,,,, ,即甲基化和羟甲基化。。。。。。。

“我们可能证明,,,,,, ,基因组中这两个象征的散布似乎被建饰的位点现实上存在很大差距,,,,,, ,”Kohli说,,,,,, ,“这一发现批注基因组上这两个象征拥有沉要而怪异的生物学作用。。。。。。。”

原文标题:

Nondestructive, base-resolution sequencing of 5-hydroxymethylcytosine using a DNA deaminase 

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