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乐投letou生物报路:4月2日,,,,,,,中国科学院北京基因组钻研所(国度生物信息中心)任捷团队和杨运桂团队,,,,,,,在《分子细胞》(Molecular Cell)上在线颁发了题为DDX21 mediates co-transcriptional RNA m6A modification to promote transcription termination and genome stability的钻研论文。。。。。。。该钻研揭示了三链核酸结构R-loop、解旋酶DDX21与m6A甲基转移酶METTL3之间的协同机造,,,,,,,以及推进转录终止、维持基因组不变性的职能。。。。。。。
在基因转录过程中,,,,,,,新天生的RNA能够和模板DNA互补,,,,,,,在染色质上形成由DNA:RNA杂合链和单链DNA组成的三链结构。。。。。。。这种核酸结构被称为R-loop。。。。。。。它的稳态失衡是多种疾病的病理基础。。。。。。。而N6-甲基腺嘌呤(m6A)是对mRNA性命周期进行调控的沉要建饰,,,,,,,参加细胞分化与个别发育、应对环境压力、免疫系统职能、肿瘤产生与发展以及病毒习染等性命过程。。。。。。。约半数m6A在新生RNA上随转录天生,,,,,,,但决定共转录建饰的产生以及这些建饰的职能尚不明显。。。。。。。
该团队通过度析m6A甲基转移酶复合物的三种关键组分免疫共沉淀的蛋白质组分,,,,,,,鉴定出DEAD-box解旋酶DDX21作为m6A甲基转移酶复合物的新型互作因子。。。。。。。进一步,,,,,,,该团队开发并利用针对新生RNA的光激活核糖核苷加强交联免疫沉淀高通量测序,,,,,,,结合基于单链DNA建库的DNA:RNA杂合链免疫共沉淀高通量测序分析,,,,,,,发现R-loop、DDX21和METTL3在基因组上拥有显著的共定位。。。。。。。当R-loop或DDX21缺失时,,,,,,,METTL3在染色质上的定位降低,,,,,,,导致染色质有关RNA(caRNA)上m6A水平降落,,,,,,,尤其是在转录终止地位。。。。。。。钻研显示,,,,,,,DDX21对m6A建饰的推进作用依赖于其解旋酶活性。。。。。。。
该钻研通过绘造RNA聚合酶转录位点的高分辨率图谱,,,,,,,揭示了DDX21与METTL3协同作用。。。。。。。钻研显示,,,,,,,通过调控m6A共转录形成,,,,,,,借助其“阅读器”蛋白YTHDC1,,,,,,,共同在推进XRN2介导的转录终止过程中阐扬作用。。。。。。。这一过程对于维持基因组的不变性至关沉要。。。。。。。阻断复造过程或者选取CRISPR靶向战术精确抑造转录,,,,,,,能够缓解转录通读区域的基因组不不变性。。。。。。。
前期工作发现m6A调控R-loop稳态的机造,,,,,,,而该钻研提出了R-loop-DDX21-METTL3介导的m6A共转录建饰的新机造,,,,,,,阐了然新生RNA若何通过m6A建饰保障基因组职能和结构不变性。。。。。。。通过协调一系列的分子招募和酶活性,,,,,,,该钻研架起了联接表观转录组、协调转录终止以及维持基因组不变性之间的桥梁。。。。。。。探求R-loop-DDX21-METTL3-m6A调控轴的主题结构域和关键酶活性,,,,,,,将有助于挖掘出可能调节m6A表观转录组的新靶点。。。。。。。
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