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清华大学性命学院戚益军课题组揭示植物Dicing body形成及miRNA天生的调控因子


?乐投letou生物报路:miRNA通过调节基因表白,,, ,,在植物成长发育、逆境响应等过程中阐扬沉要调控作用;;;;;;说明miRNA的产生和职能机造,,, ,,对于揭示基因表白调控法规、开发改进作物农艺性状的新资源拥有沉要意思。。。。。。植物miRNA由Dicer-Like 1(DCL1)、SERRATE(SE)和Hyponastic Leaves 1(HYL1)组成的复合体切割其前体pri-miRNA产生。。。。。。DCL1、HYL1及SE共定位于细胞核中并形成2-4个直径为0.2-0.8 μm的切割幼体(Dicing body)。。。。。。戚益军钻研组之前发现切割幼体由SE蛋白通过液-液相分离驱动组装形成。。。。。。miRNA前体在切割幼体中高效加工为成熟的miRNA,,, ,,成熟的miRNA随后与HYL1结合,,, ,,从切割幼体中开释至幼体表进而阐扬职能1。。。。。。这些发现阐了然植物miRNA产生的主题工作机造,,, ,,但对于切割幼体的形成及其在miRNA天生中的作用是若何得到调节的,,, ,,迄今知之甚少。。。。。。

2023年8月29日,,, ,,清华大学性命科学学院、植物生物学钻研中心戚益军钻研组在〖国国度科学院院刊》(PNAS)在线颁发题为“肽基脯氨酰异构酶CYP71推进拟南芥中SERRATE相分离和miRNA加工”(Peptidyl-prolyl isomerase Cyclophilin 71 promotes SERRATE phase separation and miRNA processing in Arabidopsis)的钻研论文。。。。。。该钻研发现环孢亲和蛋白Cyclophilin71(CYP71)利用其肽基脯氨酰异构酶(peptidyl-prolyl isomerase,,, ,,PPIase)活性推进SE相分离和切割幼体形成,,, ,,加强DCL1-SE-HYL1复合体切割活性,,, ,,从而推进miRNA加工。。。。。。该发现揭示了植物切割幼体形成及miRNA产生的沉要调节机造。。。。。。

在该钻研中,,, ,,戚益军钻研组首先通过正向遗传筛选发现,,, ,,CYP71调控miRNA的产生和植物发育(图1)。。。。。。CYP71的突变导致好多miRNA的堆集水平显著降低,,, ,,而其靶基因表白升高。。。。。。在cyp71突变体中,,, ,,MIR基因的转录水平根基没有变动,,, ,,但miRNA前体水平升高,,, ,,提醒CYP71可能正向调节miRNA加工。。。。。。

图1:CYP71突变导致拟南芥发育缺点和miRNA堆集水平降低

钻研发现,,, ,,CYP71能够与SE产生直接相互作用,,, ,,钻研组因而检测了CYP71是否调控SE相分离及切割幼体形成。。。。。。了局批注,,, ,,在体表,,, ,,CYP71推进SE相分离及切割幼体的组装,,, ,,在植物体内,,, ,,CYP71的突变会导致大无数植物细胞不能形成切割幼体(图2)。。。。。。CYP71拥有PPIase活性结构域。。。。。。通过对两个守旧的氨基酸残基(R519或F524)进行定点突变,,, ,,构建了PPIase活性减弱的CYP71变体。。。。。。发现CYP71变体不能推进SE相分离及切割幼体的组装,,, ,,注明CYP71利用其PPIase活性推进SE相分离及切割幼体形成。。。。。。

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图2:CYP71推进SE相分离和切割幼体的形成

SE可能通过驱动切割幼体的形成提高DCL1-SE-HYL1复合体的切割效能。。。。。。钻研组因而进一步检测了CYP71对miRNA加工的影响。。。。。。了局批注,,, ,,CYP71可显著提高体表沉组的切割幼体的活性,,, ,,而其PPIase活性减弱变体R519A和F524A则无推进作用。。。。。。同时,,, ,,遗传学证据批注,,, ,,CYP71的PPIase活性为植物体内miRNA的高效天生所必须。。。。。。

该钻研初次揭示了环孢亲和蛋白对miRNA加工的调控职能,,, ,,并揭示肽基脯氨酰顺反异构化在SE相分离中的沉要调控职能。。。。。。肽基脯氨酰顺反异构化是一种肽键顺式构象与反式构象之间的转变,,, ,,可通过诱导蛋白质构象变动,,, ,,扭转蛋白质的表表个性,,, ,,从而调节蛋白质分子之间的相互作用。。。。。。在幼鼠和人类细胞中,,, ,,可能相分离的蛋白质在肽基脯氨酰异构酶 A(环孢亲和蛋白A)底物中富集2,,, ,,批注肽基脯氨酰顺反异构化可能是调节蛋白质相分离的通用机造。。。。。。

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